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Wie wählt man ein fluoreszierendes quantitatives PCR-Instrument?

2020-07-14 15:32:53
Schlüsselparameter und wichtige Merkmale des quantitativen Fluoreszenz-PCR-Instruments Beim Kauf eines quantitativen Fluoreszenz-PCR-Instruments sollten mehrere Schlüsselparameter beachtet werden:

1. Der Erfassungsfluss des Instruments

Zunächst ist zu berücksichtigen, wie oft das Labor ein quantitatives PCR-Instrument verwenden muss. David Ginzinger, Leiter der Abteilung für Genomanalyse an der Universität von Kalifornien, San Francisco Cancer Center, hat die meisten quantitativen PCR-Geräte auf dem Markt getestet. Er sagte, wenn es beispielsweise nicht in großem Maßstab verwendet wird, wird es hauptsächlich zum Testen bekannter Gene verwendet, dann brauche es keine teuren High-End-Produkte. Für diejenigen Labors, die neue Wirkstofftargets und Krankheitsmarker finden müssen, benötigen sie Instrumente, die 384-Well-Platten aufnehmen und schneller laufen können. Nur ein solches Hochdurchsatzinstrument ist jedoch nicht schnell genug, und Sie werden feststellen, dass die Probenvorbereitung zu einem Engpass bei der Geschwindigkeitsbegrenzung wird. Hochdurchsatzlabors benötigen daher häufig weitere automatisierte Instrumente. Solange der Knopf gedrückt wird, verarbeitet das Instrument automatisch Proben, reinigt Nukleinsäuren und bereitet PCR-Templates vor.

2. Die Fähigkeit der Mehrfachverstärkung

Die Mehrfachverstärkung wird heißer. Quantitative Echtzeit-PCR-Geräte sind nicht immun. Das quantitative High-End-PCR-Instrument verfügt über mehrere Detektionskanäle, sodass das Instrument den Amplifikationsprozess mehrerer Templates im selben Probentank erfassen kann. Der neue LightCycler2.0 verfügt über 6 Erkennungskanäle, 3 mehr als das Original. SmartCycler® verfügt über 4 Erkennungskanäle. Stratagene, das für seine Bibliotheksprodukte bekannt ist, verfügt auch über ein quantitatives PCR-Instrument Mx3000P mit weniger als der Hälfte des Preises von Roche und einem guten Ruf, dh 4 Nachweiskanälen. Die Mehrfachamplifikation ist jedoch nicht für jeden geeignet, da sie das Experiment kompliziert.

3. Software

Wenn Sie bereit sind, ein quantitatives PCR-Instrument auszuwählen, müssen Sie die beigefügte Software überprüfen. Ist es bequem zu bedienen, können Sie die Analyse durchführen, die Sie benötigen, gibt es mehrere Ausgabeformate. Sie müssen jedoch darauf achten, ob die zu einfach zu verwendende Software eine relativ einfache Funktion hat und keine komplexen Berechnungen durchführen kann. Bei der vorherigen Software müssen Sie weitere Analysen durchführen. Die neue Software kann bereits alles verarbeiten. Zusätzlich zu den Grundfunktionen kann einige Software auch über weitere Funktionen verfügen, z. B. Primer- und Sonden-Design, Mehrfachanalyse-Design, Hintergrundkorrektur, Datennormalisierung usw. Willian Demyan, Leiter der Abteilung für Anwendung und technischen Service der Abteilung für angewandte Wissenschaft von Roche, betonte, dass quantitative PCR ein Prozess der geometrischen Amplifikation ist. Zu Beginn gibt es einen Kopierunterschied, und die Ergebnisse variieren je nach geometrischer Reihenfolge.

4. Flexibilität

Große, vielbeschäftigte Laborgeräte sind sicherlich beneidenswert, und konventionelle Labors können ebenfalls eine wunderbare Auswahl treffen. Die derzeitigen Lieferanten verfügen über viele technische Experten, die nicht nur Ihre aktuellen Anforderungen verstehen, sondern auch sehr nachdenklich sind, um mögliche zukünftige Änderungen der Nachfrage zu berücksichtigen, z. B. die Bereitstellung einer Vielzahl von aufrüstbaren Zubehörteilen und Modulen. Mit MyCycler von BioRad können Module ausgewählt und auf Echtzeitquantifizierung aktualisiert werden. Das quantitative PCR-Instrument von ABI verfügt über eine Vielzahl verschiedener Probentanks, mit denen 96-Well-Tanks in doppelte 384-Well-Tanks umgewandelt werden können, um einige Anforderungen an einen hohen Durchsatz zu erfüllen. Für Laboratorien, die gerade mit der Durchführung von qPCR in kleinen Mengen begonnen haben, ist das quantitative PCR-Instrument SmartCycler II eine gute Wahl. Ein Basismodul verfügt über 16 unabhängige Probentanks zur Temperaturregelung, und 16 völlig unabhängige verschiedene Experimente können gleichzeitig oder vorher und nachher durchgeführt werden. "Zugang": Wenn das Labor ein größeres Experiment benötigt, kann es sehr wirtschaftlich von 1 auf 6 Grundmodule aufgerüstet werden, was 96 Probenvertiefungen entspricht. Obwohl 96-Well-Platten nicht verwendet werden können, können andere Schüler jederzeit einstecken, um ihre eigenen unabhängigen Experimente zu starten, und sie stören sich nicht gegenseitig, was die Flexibilität erhöht. Es ist eine sehr flexible Option für Laboratorien, die nur wenige Experimente durchführen und zu Beginn ein knappes Budget haben.

5. Unsicherheit

Obwohl die Software teilweise korrigiert werden kann, ist es besser, ein Instrument mit weniger systematischen Fehlern zu kaufen, ohne so viele Berechnungskorrekturen zu erfordern, als durch Berechnung. Cinzinger ist der Ansicht, dass den Unterschieden zwischen den Probenvertiefungen des Instruments besondere Aufmerksamkeit gewidmet werden sollte. Zusätzlich zu den bekannten Temperaturunterschieden zwischen den Probenlöchern gibt es auch kleine Unterschiede im optischen Wegabstand zwischen dem Probenloch und der Detektionssonde, kleine Unterschiede in der Länge der Faser, die für das Senden und Empfangen von Signalen verantwortlich ist, und kleine Unterschiede im Abstand und Winkel zwischen der Linse und dem Probenloch. Die Wirkung der Probenzelle auf die Signalübertragung. Cinzinger hat den gleichen Test mit den meisten im Handel erhältlichen quantitativen PCR-Instrumenten durchgeführt. Er amplifiziert die gleichen Proben und Reagenzien in Echtzeit in jeder Vertiefung des Instruments. Leider gibt es oft unterschiedliche Ergebnisse zwischen verschiedenen Probenvertiefungen.

6. Auswahl der Kits

Obwohl die Vertriebsmitarbeiter über hervorragende Qualitätskontroll-Kits verfügen und Lösungen Einzelergebnisse erzielen, ist der Kauf von Standard-Kits keine Lösung für die Unterschiede. Ernsthafte Bewertungsexperimente und analytische Experimente sind die Lösungen.

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